А.Н. Шишкин родился 13 марта 1959 года Красноярске.

В 1985 году окончил Московский институт нефтехимической и газовой промышленности по специальности «промышленная теплоэнергетика» и получил квалификацию «инженер-промтеплоэнергетик».

В 1991-2005 годах занимал руководящие должности в различных кредитно-финансовых учреждениях.

В 2005 году назначен генеральным директором ОАО «Уральская энергетическая управляющая компания», возглавил ОАО «Тюменская энергосбытовая компания», а затем ОАО «ТГК-10».

За добросовестный труд удостоен Почетного звания "Заслуженный работник Единой энергетической системы России" и Почетного знака «За заслуги перед российской электроэнергетикой».

20.01.2010 г. приказом премьер-министра РФ В. Путина назначен на должность заместителя министра энергетики РФ.

С июня 2012 г. - Заместитель главы ОАО “НК “Роснефть”.